【佳作推薦】浙江工業(yè)大學(xué)張貴軍教授小組JCIM論文:基于深度學(xué)習(xí)的端到端蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域組裝方法

2023-11-19 轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)新前沿 J CHEM INF MODEL

該方法利用深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò),通過注意力機(jī)制融合多種特征來預(yù)測域間相互作用,再將其轉(zhuǎn)換為域間剛性運(yùn)動(dòng)變換,實(shí)現(xiàn)端到端的蛋白結(jié)構(gòu)域組裝和多域蛋白質(zhì)預(yù)測。

深度學(xué)習(xí) 端到端蛋白質(zhì) 多域蛋白質(zhì)全鏈

PNAS 同濟(jì)大學(xué)毛志勇/魏珂團(tuán)隊(duì)揭示兒童早衰癥小鼠DNA修復(fù)缺陷導(dǎo)致心肌萎縮發(fā)生的分子機(jī)制并提供潛在干預(yù)對(duì)策

2023-11-19 心血管新前沿 P NATL ACAD SCI USA

在該工作中,研究團(tuán)隊(duì)成員發(fā)現(xiàn):HGPS小鼠心臟及心肌細(xì)胞變小,心臟功能顯著下降,呈現(xiàn)心肌萎縮的表型。

DNA損傷 兒童早衰癥 心肌萎縮

Nature Genetics:中山大學(xué)鄭健/林東昕發(fā)現(xiàn)胰腺癌seRNA甲基化調(diào)控組蛋白修飾和癌基因表達(dá)新機(jī)制

2023-11-19 轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)新前沿 NAT GENET

該研究描繪了胰腺導(dǎo)管腺癌(PDAC)中超增強(qiáng)子RNA (seRNA) m6?A修飾的圖景,并揭示了m6?A seRNA、H3K4me3修飾、染色質(zhì)可及性和癌基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控軸。

胰腺癌 組蛋白修飾 m6?A seRNA seRNA甲基化

Nature Aging:這種天然產(chǎn)物,增強(qiáng)線粒體功能,壽命延長40%

2023-11-18 轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)新前沿 Nat Aging

研究顯示,天然產(chǎn)物香豆素可以增強(qiáng)溶酶體功能,誘導(dǎo)線粒體自噬并改善線粒體功能,MIC給藥成年的秀麗隱桿線蟲1-7天,可使其平均壽命延長40%。

香豆素 線粒體功能障礙 平均壽命 線粒體自噬

Nature子刊:這種常見的維生素,竟促進(jìn)癌癥生長,減少攝入可抑制癌癥

2023-11-18 腫瘤新前沿 Nat metab

該研究顯示,在人類和小鼠乳腺癌模型中,高表達(dá)MYC的乳腺癌細(xì)胞嚴(yán)重依賴維生素B5來生長和存活,而通過飲食限制維生素B5的攝入,會(huì)導(dǎo)致許多MYC介導(dǎo)的代謝變化逆轉(zhuǎn),并抑制腫瘤生長。

腫瘤 乳腺癌 維生素B5

【佳作推薦】McMaster大學(xué)Stokes小組和麻省理工學(xué)院Collins小組NCB論文:深度學(xué)習(xí)指導(dǎo)窄譜抗生素設(shè)計(jì)

2023-11-17 轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)新前沿 NAT CHEM BIOL

傳統(tǒng)的抗生素研發(fā)方法難以有效抑制Ab的耐藥性擴(kuò)散,且廣譜抗生素的使用往往會(huì)加劇耐藥性問題。因此,使用新方法尋找新型窄譜抗生素是一種可行的解決方案。

鮑曼不動(dòng)桿菌 窄譜抗生素

Nat Genet:基于健康單細(xì)胞參考圖譜準(zhǔn)確識(shí)別scRNA-seq數(shù)據(jù)中疾病相關(guān)細(xì)胞狀態(tài)

2023-11-17 轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)新前沿 NAT GENET

研究團(tuán)隊(duì)評(píng)估了單細(xì)胞參考圖譜的選擇如何影響從疾病樣本scRNA-seq數(shù)據(jù)中識(shí)別細(xì)胞狀態(tài)變化。

scRNA-Seq 單細(xì)胞參考圖譜

JAMA Oncol:胚系癌癥易感性檢測中加入RNA測序?qū)⑷绾翁岣邷?zhǔn)確性和臨床敏感性?

2023-11-16 腫瘤新前沿 JAMA ONCOL

研究顯示,RNA測序與診斷陽性率增加和胚系癌癥易感性MGPT檢測的意義不明變異(VUS)率降低有關(guān),17.1%的剪接變異被歸類為致病性,71.1%的意義不明剪接變異被判定為良性。

RNA測序 胚系癌癥易感性

Adv Sci:段晨陽/李濤/劉良明團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)急性缺血缺氧狀態(tài)下Drp1通過細(xì)胞骨架引起細(xì)胞器互作紊亂的關(guān)鍵機(jī)制

2023-11-16 轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)新前沿 ADV SCI

研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),在急性缺血缺氧損傷情況下,細(xì)胞質(zhì)中的Drp1在被招募到線粒體之前,已經(jīng)開始發(fā)生活性修飾,并參與到線粒體分裂的準(zhǔn)備階段。

Drp1 急性缺血缺氧損傷

JAMA子刊:少吃這類食品,加速大腦衰老,認(rèn)知能力下降加速28%

2023-11-16 預(yù)防公衛(wèi)新前沿 JAMA NEUROL

研究顯示,攝入超加工食品或與加速大腦衰老有關(guān),與食用最少的人相比,食用最多超加工食品的人,整體認(rèn)知能力下降速度加快28%,執(zhí)行功能下降速度加快25%。

大腦衰老 超加工食品

Nature Aging:間歇性禁食延長壽命的機(jī)制找到了

2023-11-16 轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)新前沿 Nat Aging

該研究顯示,在年輕動(dòng)物中,禁食-再進(jìn)食周期會(huì)觸發(fā)編碼AMP激活蛋白激酶(AMPK)調(diào)節(jié)亞基Prkag1和Prkag2的基因的反向振蕩表達(dá),而在老年動(dòng)物中,衰老會(huì)削弱這種調(diào)節(jié),導(dǎo)致Prkag1表達(dá)減少。

間歇性禁食 AMP激活蛋白激酶

Genome Research:陳河兵/李程合作團(tuán)隊(duì)發(fā)表基于機(jī)器學(xué)習(xí)的單細(xì)胞年齡預(yù)測方法SCALE

2023-11-14 轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)新前沿 GENOME RES

該研究利用基因表達(dá)調(diào)控在衰老過程中的變化,構(gòu)建了一種基于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的生物學(xué)年齡估計(jì)模型(Single-cell aging-level estimator, SCALE)。

單細(xì)胞年齡預(yù)測 生物學(xué)年齡估計(jì)模型

Cell子刊:油酸能抑制鐵死亡,有望治療鐵過載相關(guān)疾病

2023-11-14 轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)新前沿 CELL CHEM BIOL

鐵死亡是2012年由哥倫比亞大學(xué) Brent Stockwell 實(shí)驗(yàn)室發(fā)現(xiàn)的一種鐵依賴性的新型細(xì)胞程序性死亡方式,由過度堆積的過氧化脂質(zhì)(peroxidized lipids)誘導(dǎo)發(fā)生,其形態(tài)特征,

鐵死亡 油酸 鐵過載

劉勇/葉方富/李圓鳳/胡榮黨AM: 含Pd納米粒子的金屬-酚醛網(wǎng)絡(luò)介導(dǎo)的協(xié)同抗菌系統(tǒng),有效根除口腔多菌生物被膜相關(guān)感染

2023-11-13 口腔科新前沿 ADV MATER

通過建立根管模型和口咽念珠菌感染模型,進(jìn)一步驗(yàn)證了協(xié)同抗菌系統(tǒng)治療口腔生物被膜相關(guān)感染的可行性。該系統(tǒng)為口腔多菌生物被膜相關(guān)感染提供了一種很有前途的治療方法。

口腔多菌生物 金屬-酚醛網(wǎng)絡(luò)

合成全部16條染色體!國際酵母基因組合成計(jì)劃(Sc2.0)實(shí)現(xiàn)里程碑式突破

2023-11-11 轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)新前沿

研究團(tuán)隊(duì)已合成酵母的全部16條染色體,包括一個(gè)全新合成的tRNA染色體,并構(gòu)建了一種包含50%合成DNA的酵母菌株,其表現(xiàn)出活躍的增殖和正常的細(xì)胞形態(tài)、長度和形狀。

酵母基因組

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