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Journal of Chemical Information and Modeling

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【佳作推薦】浙江工業(yè)大學(xué)張貴軍教授小組JCIM論文:基于深度學(xué)習(xí)的端到端蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域組裝方法

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該方法利用深度學(xué)習(xí)網(wǎng)絡(luò),通過注意力機(jī)制融合多種特征來預(yù)測域間相互作用,再將其轉(zhuǎn)換為域間剛性運(yùn)動變換,實(shí)現(xiàn)端到端的蛋白結(jié)構(gòu)域組裝和多域蛋白質(zhì)預(yù)測。

四川大學(xué)華西藥學(xué)院王乾韜小組JCIM論文:微秒級分子動力學(xué)模擬驅(qū)動MTDH-SND1蛋白-蛋白相互作用抑制劑的發(fā)現(xiàn)

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蛋白-蛋白相互作用是調(diào)控生物過程的重要媒介,與癌癥等多種疾病密切相關(guān)。但PPI作用界面往往具有動態(tài)、寬泛和缺乏明確結(jié)合口袋等特點(diǎn),導(dǎo)致PPI抑制劑的合理藥物設(shè)計(jì)具有較大挑戰(zhàn)。