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Nat Commun:跨越39種人類細(xì)胞類型的等位基因特異性DNA甲基化綜合圖譜
該團(tuán)隊(duì)開發(fā)了用于鑒定和表征等位基因特異性甲基化的算法,繪制了跨越39種人類細(xì)胞類型的等位基因特異性DNA甲基化綜合圖譜。
測(cè)序中國(guó) - DNA甲基化,等位基因特異性 - 2025-03-18
GENOME BIOLOGY:對(duì)DNA甲基化的遺傳影響有助于闡明調(diào)節(jié)基因組過程
本文的發(fā)現(xiàn)改善了DNA甲基化變異性背后的機(jī)制的特征,并為功能隨訪的GWAS變體的優(yōu)先排序提供了信息。
MedSci原創(chuàng) - 基因組,DNA甲基化 - 2023-08-06
Nature:懷孕與逆齡的奇妙聯(lián)系:科學(xué)揭示生育對(duì)DNA的年輕化效應(yīng)
研究表明,懷孕可以引起與衰老相關(guān)的甲基化模式的改變,而這些改變?cè)诜置浜罂赡軙?huì)部分逆轉(zhuǎn)。
生物探索 - 懷孕,逆齡 - 2024-03-27
Nat Commun:無需預(yù)處理的新qPCR技術(shù)EpiDirect?,可直接定量DNA甲基化
研究團(tuán)隊(duì)提出了一種新型qPCR技術(shù)——EpiDirect?,其基于嵌入性核酸(INA?)經(jīng)特殊引物設(shè)計(jì)后可區(qū)分甲基化和未甲基化胞嘧啶這一原理,能夠使用未處理的DNA直接進(jìn)行DNA甲基化的PCR定量。
測(cè)序中國(guó) - DNA甲基化,qPCR技術(shù) - 2023-09-11
BMC Med.:中國(guó)學(xué)者開發(fā)了一種用于檢測(cè)肝硬化各階段肝細(xì)胞癌的新型雙靶血液檢測(cè)方法
本研究開發(fā)并驗(yàn)證了一種名為Qliver的MS-qPCR檢測(cè)方法。與目前廣泛使用的血液生物標(biāo)志物相比,Qliver在檢測(cè)HCC方面表現(xiàn)出了更優(yōu)異的性能,表明其在高危人群的HCC監(jiān)測(cè)中具有潛在的臨床益處。
MedSci原創(chuàng) - 肝細(xì)胞癌,HCC,新檢測(cè)方法,IMS-III試驗(yàn),MS-qPCR - 2025-05-15
NCB:復(fù)旦大學(xué)溫文玉團(tuán)隊(duì)揭示氧化還原敏感的MBD2-NuRD凝聚體的促癌機(jī)制
該研究表明甲基CpG結(jié)合域蛋白2 (MBD2)在不同的癌細(xì)胞中形成核凝聚體,在那里它聚集并引導(dǎo)染色質(zhì)重塑NuRD復(fù)合物到這些基因位點(diǎn)進(jìn)行轉(zhuǎn)錄抑制,從而促進(jìn)腫瘤生長(zhǎng)。
iNature - 腫瘤抑制基因,MBD2 - 2025-05-03
Nature:DNA甲基化:從星形膠質(zhì)細(xì)胞到神經(jīng)干細(xì)胞的轉(zhuǎn)化之鑰
揭示了DNA甲基化在星形膠質(zhì)細(xì)胞向干性轉(zhuǎn)變中的核心作用。研究發(fā)現(xiàn),神經(jīng)干細(xì)胞的功能依賴于星形膠質(zhì)細(xì)胞基因的甲基化,以及干細(xì)胞相關(guān)基因的去甲基化。
生物探索 - 神經(jīng)干細(xì)胞,星形膠質(zhì)細(xì)胞,DNA甲基化 - 2024-09-07
驅(qū)動(dòng)癌癥細(xì)胞免疫調(diào)節(jié)功能的機(jī)制
異常免疫反應(yīng)被廣泛認(rèn)為是癌癥的標(biāo)志,并為癌癥治療提供了有吸引力的靶點(diǎn)。
小藥說藥 - 癌癥治療,異常免疫反應(yīng) - 2024-08-17
Clin Cancer Res:許劍民/樊嘉/張瑋/何川團(tuán)隊(duì)合作構(gòu)建基于全基因組5hmc的結(jié)直腸癌及進(jìn)展期腺瘤早篩模型
基于血液cfDNA進(jìn)行全基因組5hmC水平檢測(cè),其檢出結(jié)直腸癌和進(jìn)展期腺瘤的靈敏度優(yōu)于CEA等目前常用的各種標(biāo)志物,而且由于其無創(chuàng)的特點(diǎn),可以更加方便地加以推廣。
測(cè)序中國(guó) - 結(jié)直腸癌,腺瘤,全基因組5hmc - 2024-06-08
Nat Commun:FinaleMe模型:基于血漿cfDNA片段化模式預(yù)測(cè)DNA甲基化水平和起源組織狀態(tài)
研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一種名為FinaleMe的計(jì)算方法,可預(yù)測(cè)每個(gè)cfDNA片段中每個(gè)CpG的DNA甲基化狀態(tài),并獲得CpG位點(diǎn)的連續(xù)DNA甲基化水平;進(jìn)一步從推斷的甲基化模式中預(yù)測(cè)相關(guān)的起源組織狀態(tài)。
測(cè)序中國(guó) - cfDNA,DNA甲基化 - 2024-04-29
特別關(guān)注|非酒精性脂肪性肝病多組學(xué)研究現(xiàn)狀
本文主要綜述與NAFLD相關(guān)的多組學(xué)研究進(jìn)展,以期為NAFLD的預(yù)防和治療提供更豐富的理論依據(jù)與新的策略。
臨床肝膽病雜志 - 非酒精性脂肪性肝病,基因組學(xué),蛋白質(zhì)組學(xué),代謝組學(xué) - 2024-07-20
PLOS Med:超萬人EWAS研究揭示與多種常見疾病關(guān)聯(lián)的甲基化位點(diǎn)
該研究共確定了100多個(gè)CpG甲基化位點(diǎn)與4種疾病的患病率和2種疾病的發(fā)病率之間的關(guān)聯(lián)。
測(cè)序中國(guó) - DNA甲基化 - 2023-07-26
PNAS:謝曉亮課題組開發(fā)新型單細(xì)胞甲基化與羥甲基化測(cè)序技術(shù)
該研究利用該技術(shù)描繪了小鼠早期胚胎發(fā)育過程中甲基化、羥甲基化以及半甲基化修飾的動(dòng)態(tài)變化,揭示了小鼠早期胚胎甲基化重編程過程中主動(dòng)/被動(dòng)去甲基化的活力變化以及參與父母本基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制的差異。
測(cè)序中國(guó) - DNA甲基化,單細(xì)胞甲基化,羥甲基化測(cè)序技術(shù) - 2023-12-19
全基因組甲基化研究技術(shù)原理介紹
DNA甲基化是基因組DNA的一種主要表觀遺傳修飾形式。近年來,大量研究表明DNA甲基化修飾對(duì)于維持正常細(xì)胞功能、傳遞基因組遺傳印記、胚胎發(fā) 育以及人類腫瘤發(fā)生,起著至關(guān)重要的作用。甲基化研究成為表觀遺傳學(xué)的熱點(diǎn),相應(yīng)的技術(shù)也是層出不窮,根據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)康牡牟煌@些技術(shù)大體能夠分成兩類:全 基因組(高通量)甲基化研究技術(shù)以及特異性甲基化位點(diǎn)(低通量)研究技術(shù)。下面將介紹幾種當(dāng)前最常用的一些技術(shù)全
MedSci原創(chuàng) - 甲基化,基因組 - 2014-02-05
全基因組重亞硫酸鹽測(cè)序(whole genome bisulfite sequencing)用于全基因組DNA甲基化檢測(cè)
表觀遺傳學(xué)研究已經(jīng)證實(shí)了特定基因區(qū)域的DNA甲基化修飾對(duì)于染色體構(gòu)象、基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制有著重要影響,而全基因組DNA甲基化研究將是表觀基因組學(xué)最為關(guān)注的內(nèi)容之一。 Bisulfite處理能夠?qū)⒒蚪M中未發(fā)生甲基化的C堿基轉(zhuǎn)換成U,進(jìn)行PCR擴(kuò)增后變成T,與原本具有甲基化修飾的C堿基區(qū)分開來,再結(jié)合高通量測(cè)序技術(shù),可繪制單堿基分辨率的全基因組DNA甲基化圖譜。 特定物種的高精確度甲基
MedSci原創(chuàng) - DNA甲基化,基因組 - 2014-02-05
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