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J Hematol Oncol:全景空間增強(qiáng)分辨率蛋白質(zhì)組學(xué)(PSERP)解析膠質(zhì)瘤空間蛋白質(zhì)組異質(zhì)性

J Hematol Oncol:全景空間增強(qiáng)分辨率蛋白質(zhì)組學(xué)(PSERP)解析膠質(zhì)瘤空間蛋白質(zhì)組異質(zhì)性

研究人員希望深入解析膠質(zhì)瘤的腫瘤微環(huán)境和異質(zhì)性,揭示不同基因突變類型膠質(zhì)瘤的蛋白質(zhì)組特征,探索腫瘤特異性蛋白和信號(hào)通路,為膠質(zhì)瘤的精準(zhǔn)治療和免疫治療提供新靶點(diǎn)和策略。

MedSci原創(chuàng) - 膠質(zhì)瘤,空間蛋白質(zhì)組學(xué) - 2025-07-26

Cell子刊:定制化、低成本的高分辨率納米圖案空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)平臺(tái)Nova-ST

Cell子刊:定制化、低成本的高分辨率納米圖案空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)平臺(tái)Nova-ST

介紹新型空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù) Nova-ST,闡述其工作流程、性能優(yōu)勢(shì)及與其他技術(shù)比較,為大規(guī)模空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析提供新方法。

測(cè)序中國(guó) - 空間轉(zhuǎn)錄組學(xué),Nova-ST - 2024-09-05

Nature:空間組學(xué):重新定義腫瘤異質(zhì)性,開創(chuàng)精準(zhǔn)癌癥治療新紀(jì)元

Nature:空間組學(xué):重新定義腫瘤異質(zhì)性,開創(chuàng)精準(zhǔn)癌癥治療新紀(jì)元

癌癥生物學(xué)復(fù)雜,空間組學(xué)為其研究帶來新視角,可解析腫瘤微環(huán)境異質(zhì)性,介紹其崛起歷程、與單細(xì)胞組學(xué)結(jié)合意義、平臺(tái)比較選擇,闡述空間蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)應(yīng)用及挑戰(zhàn)未來,助力癌癥研究與個(gè)性化治療。

生物探索 - 癌癥,腫瘤微環(huán)境,空間組學(xué) - 2024-11-27

J Hematol Oncol:?jiǎn)渭?xì)胞與空間組學(xué)技術(shù),解析癌癥耐藥機(jī)制的 “微觀利器”

J Hematol Oncol:?jiǎn)渭?xì)胞與空間組學(xué)技術(shù),解析癌癥耐藥機(jī)制的 “微觀利器”

這篇綜述結(jié)合單細(xì)胞技術(shù)的高速發(fā)展和空間組學(xué)技術(shù)的創(chuàng)新應(yīng)用,梳理了當(dāng)前癌癥臨床治療中藥物反應(yīng)及耐藥性的關(guān)鍵細(xì)胞指標(biāo),為個(gè)體化精準(zhǔn)診療提供了科學(xué)支撐。

MedSci原創(chuàng) - 癌癥耐藥,單細(xì)胞,空間組學(xué)技術(shù) - 2025-07-13

Nature Genetics:BANKSY:革命性算法,重塑空間組學(xué)數(shù)據(jù)分析

Nature Genetics:BANKSY:革命性算法,重塑空間組學(xué)數(shù)據(jù)分析

該算法作為一種創(chuàng)新的空間組學(xué)數(shù)據(jù)分析工具,其主要功能是將空間組學(xué)數(shù)據(jù)中的細(xì)胞根據(jù)類型和組織域進(jìn)行有效分類。

生物探索 - 空間組學(xué),BANKSY - 2024-03-04

Nature Methods:納米孔技術(shù):?jiǎn)畏肿訒r(shí)間組學(xué)的利器

Nature Methods:納米孔技術(shù):?jiǎn)畏肿訒r(shí)間組學(xué)的利器

文章深入探討了納米孔技術(shù)如何突破傳統(tǒng)技術(shù)的局限,為研究人員揭開生物分子網(wǎng)絡(luò)中的奧秘提供強(qiáng)有力的支持。

生物探索 - 納米孔技術(shù),單分子時(shí)間組學(xué) - 2024-11-22

重磅|浙大、北大、華大團(tuán)隊(duì)聯(lián)合發(fā)表單細(xì)胞及空間組學(xué)大綜述

重磅|浙大、北大、華大團(tuán)隊(duì)聯(lián)合發(fā)表單細(xì)胞及空間組學(xué)大綜述

該綜述以超長(zhǎng)篇幅(近3萬字,700多篇文獻(xiàn))系統(tǒng)性梳理了單細(xì)胞和空間基因組學(xué)領(lǐng)域的歷史、進(jìn)展、應(yīng)用與展望。

iNature - 單細(xì)胞,空間基因組學(xué) - 2025-01-06

Genome Biol綜述 | 多模態(tài)和單細(xì)胞/亞細(xì)胞水平空間組學(xué)技術(shù)的現(xiàn)狀及發(fā)展前景

Genome Biol綜述 | 多模態(tài)和單細(xì)胞/亞細(xì)胞水平空間組學(xué)技術(shù)的現(xiàn)狀及發(fā)展前景

空間組學(xué)領(lǐng)域在過去幾年蓬勃發(fā)展,并從根本上提高了原位實(shí)驗(yàn)的廣度和分辨率。這些技術(shù)現(xiàn)在可以在50-100nm的空間分辨率下檢測(cè)超過10,000個(gè)獨(dú)特的基因靶點(diǎn)。

測(cè)序中國(guó) - 多模態(tài)和單細(xì)胞,亞細(xì)胞水平空間組學(xué)技術(shù),空間組學(xué)實(shí)驗(yàn) - 2022-12-29

Nature子刊:戴瓊海/鄧岳團(tuán)隊(duì)構(gòu)建多模態(tài)融合的深度生成模型soScope,可高分辨率表征復(fù)雜組織結(jié)構(gòu)

Nature子刊:戴瓊海/鄧岳團(tuán)隊(duì)構(gòu)建多模態(tài)融合的深度生成模型soScope,可高分辨率表征復(fù)雜組織結(jié)構(gòu)

研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了一個(gè)統(tǒng)一的生成式模型“soScope”,可提高從各種空間技術(shù)獲得的分子圖譜數(shù)據(jù)質(zhì)量和空間分辨率。

測(cè)序中國(guó) - 分辨率,soScope - 2024-08-17

讀書報(bào)告 | 空間組學(xué)在癌癥診療中的突破與挑戰(zhàn)

讀書報(bào)告 | 空間組學(xué)在癌癥診療中的突破與挑戰(zhàn)

關(guān)注AI病理模型的臨床試點(diǎn)應(yīng)用,了解其在實(shí)際臨床中的表現(xiàn)和價(jià)值。在臨床試驗(yàn)中探索空間標(biāo)志物的預(yù)測(cè)價(jià)值,為未來的精準(zhǔn)治療提供更多的依據(jù)。

iCombo - 癌癥診療,空間組學(xué) - 2025-05-29

Nat Commun:打破傳統(tǒng)局限!SIMVI深度學(xué)習(xí)框架精準(zhǔn)分離空間組學(xué)數(shù)據(jù)中內(nèi)在及空間誘導(dǎo)細(xì)胞狀態(tài)

Nat Commun:打破傳統(tǒng)局限!SIMVI深度學(xué)習(xí)框架精準(zhǔn)分離空間組學(xué)數(shù)據(jù)中內(nèi)在及空間誘導(dǎo)細(xì)胞狀態(tài)

美國(guó)耶魯大學(xué) Yuval Kluger 團(tuán)隊(duì)發(fā)布空間相互作用模型 SIMVI,它能解耦空間組學(xué)數(shù)據(jù)中細(xì)胞內(nèi)在和空間誘導(dǎo)變異,在多組數(shù)據(jù)集測(cè)試中性能優(yōu)于現(xiàn)有方法,為空間組學(xué)分析提供有力工具。

測(cè)序中國(guó) - 空間組學(xué),SIMVI - 2025-04-13

Cell Discov:復(fù)旦大學(xué)樊嘉等團(tuán)合作發(fā)現(xiàn)基質(zhì)結(jié)構(gòu)和成纖維細(xì)胞亞群對(duì)肝細(xì)胞癌結(jié)局產(chǎn)生相反的影響

Cell Discov:復(fù)旦大學(xué)樊嘉等團(tuán)合作發(fā)現(xiàn)基質(zhì)結(jié)構(gòu)和成纖維細(xì)胞亞群對(duì)肝細(xì)胞癌結(jié)局產(chǎn)生相反的影響

該研究通過將病理圖像分析與空間蛋白質(zhì)組學(xué)相結(jié)合,研究揭示了肝細(xì)胞癌(HCC)中具有不同生物學(xué)功能和細(xì)胞外基質(zhì)組成的兩種基質(zhì)原型。

iNature - 肝細(xì)胞癌,成纖維細(xì)胞亞群 - 2025-02-05

Mol Cancer:彭勇/姚曉軍合作發(fā)表空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)及其在癌癥研究中的應(yīng)用進(jìn)展的綜述

Mol Cancer:彭勇/姚曉軍合作發(fā)表空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)及其在癌癥研究中的應(yīng)用進(jìn)展的綜述

該文章概述了空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)的發(fā)展、空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)工具及其在癌癥研究中的應(yīng)用,并討論了當(dāng)前空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法的局限性和挑戰(zhàn),以及未來的發(fā)展和前景。

iNature - 癌癥研究,空間轉(zhuǎn)錄組學(xué) - 2024-07-24

stClinic:左春滿/陳洛南團(tuán)隊(duì)開發(fā)動(dòng)態(tài)演變網(wǎng)絡(luò)模型,集成空間多切片多組學(xué)數(shù)據(jù)解析臨床相關(guān)微環(huán)境特性

stClinic:左春滿/陳洛南團(tuán)隊(duì)開發(fā)動(dòng)態(tài)演變網(wǎng)絡(luò)模型,集成空間多切片多組學(xué)數(shù)據(jù)解析臨床相關(guān)微環(huán)境特性

該方法以動(dòng)態(tài)演化網(wǎng)絡(luò)為框架,融合來自多個(gè)患者的空間多組學(xué)與臨床信息,識(shí)別病人間共性與特異的niche,并量化其對(duì)臨床表現(xiàn)的影響。

BioMed科技 - 腫瘤微環(huán)境,空間多組學(xué) - 2025-06-19

Nature Methods:基因“看見”形態(tài),圖像“聽懂”基因:OmiCLIP如何打破生命科學(xué)的“巴別塔”?

Nature Methods:基因“看見”形態(tài),圖像“聽懂”基因:OmiCLIP如何打破生命科學(xué)的“巴別塔”?

研究開發(fā)OmiCLIP視覺組學(xué)基礎(chǔ)模型及Loki平臺(tái),通過對(duì)比學(xué)習(xí)整合220萬對(duì)組織病理圖像與空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),實(shí)現(xiàn)高精度組織對(duì)齊、細(xì)胞分解、基因表達(dá)預(yù)測(cè)等五大功能,為空間生物學(xué)和精準(zhǔn)醫(yī)療提供新工具。

生物探索 - 空間轉(zhuǎn)錄組學(xué),組織病理圖像 - 2025-06-08

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