Nature：Illumina AI實(shí)驗(yàn)室等團(tuán)隊(duì)識(shí)別239種靈長(zhǎng)類動(dòng)物基因組的約束調(diào)控序列元件
研究人員通過構(gòu)建239種靈長(zhǎng)類動(dòng)物的全基因組多序列比對(duì)（MSA），分析了靈長(zhǎng)類動(dòng)物中約束序列元件（CSE）的特征。
測(cè)序中國(guó) - 非編碼DNA，全基因組多序列比對(duì)，約束序列元件 - 2023-12-13
Nature子刊：基于癌癥患者血漿游離RNA（cfRNA）重復(fù)序列元件檢測(cè)方法，助力診斷標(biāo)志物開發(fā)及腫瘤分型
研究團(tuán)隊(duì)開發(fā)了cfRNA轉(zhuǎn)錄組中重復(fù)元件的檢測(cè)方法COMPLETE-seq，揭示了使用該RNA液體活檢重復(fù)感知測(cè)序技術(shù)廣泛表征cfRNA轉(zhuǎn)錄組的價(jià)值和實(shí)用性。
測(cè)序中國(guó) - 癌癥，cfRNA - 2023-09-19
J Clin Oncol：雄激素阻斷治療和外束放射治療在局部前列腺癌中的治療序列研究
劑量升級(jí)的放射治療（RT）與雄激素阻斷治療（ADT）是局部前列腺癌（LPCa）的一種根治性標(biāo)準(zhǔn)方案。這些療法的最優(yōu)順序不清楚。最近，有研究人員在III期試驗(yàn)中比較了新輔助療法與同步使用ADT聯(lián)合劑量升
MedSci原創(chuàng) - 雄激素阻斷療法 前列腺癌 放療 - 2020-03-18
Nature子刊：譚濟(jì)民/夏波等開發(fā)基因組構(gòu)象預(yù)測(cè)模型C.Origami及高通量計(jì)算遺傳篩選新方法
未來(lái)的基因組學(xué)研究將更多的轉(zhuǎn)向使用利用深度學(xué)習(xí)模型作為工具來(lái)進(jìn)行主要計(jì)算遺傳篩選，并輔以生物實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的新一代高通量研究方法。
生物世界 - C.Origami，基因組構(gòu)象 - 2023-01-11
Nature biotechnology：新發(fā)現(xiàn)染色質(zhì)絕緣子或可用于人類基因治療
George Stamatoyannopoulos等人研究出一種能夠識(shí)別作為絕緣子發(fā)揮功能的緊湊序列元件的方法，或?qū)?shí)現(xiàn)基因
生物谷 - 染色質(zhì)，基因治療 - 2015-02-02
Sci Transl Med：新機(jī)器學(xué)習(xí)方法ARTEMIS繪制人類癌癥重復(fù)元件圖譜，助力癌癥早期檢測(cè)和組織溯源
以上分析揭示了人類癌癥重復(fù)元件圖譜的廣泛變化，并提供了一種無(wú)創(chuàng)檢測(cè)和表征癌癥的方法，這可能有利于癌癥患者的早期檢測(cè)和疾病監(jiān)測(cè)。
測(cè)序中國(guó) - 癌癥，重復(fù)元件圖譜 - 2024-04-24
Nature Cell Biology：北京大學(xué)韓敬東團(tuán)隊(duì)揭示 KCNQ1OT1參與細(xì)胞衰老過程的分子機(jī)制
作者發(fā)現(xiàn)抑制KCNQ1OT1基因的表達(dá)會(huì)引起與細(xì)胞衰老相關(guān)的表型，包括衰老相關(guān)基因表達(dá)上調(diào)和?-半乳糖苷酶染色陽(yáng)性，相反活化KCNQ1OT1啟動(dòng)子可以挽救KCNQ1OT1下調(diào)導(dǎo)致的L1甲基化丟失。
"小柯生命"公眾號(hào) - 細(xì)胞衰老，韓敬東 - 2022-10-24
Nat Struct Mol Biol：錢書兵組揭示5'UTR在mRNA翻譯和穩(wěn)定性中的作用
，mRNA究竟何時(shí)被當(dāng)做模板被翻譯以及何時(shí)被認(rèn)為不再需要被降解因子分解，還有哪些mRNA容易或者難以被翻譯，哪些mRNA容易被降解，潛在的機(jī)制又是什么，這些問題一直困擾著我們。
BioArt - mRNA，核糖體，降解，mRNA翻譯 - 2020-07-31
circRNADb：首個(gè)匯總編碼蛋白環(huán)狀RNA的數(shù)據(jù)庫(kù)
10月11日，Nature出版集團(tuán)子刊Scientific Reports在線發(fā)表了南京醫(yī)科大學(xué)Li Yan團(tuán)隊(duì)的一項(xiàng)重要環(huán)狀RNA研究成果，介紹開發(fā)了首個(gè)匯總可編碼蛋白的環(huán)狀RNA的數(shù)據(jù)庫(kù)：circRNADb(Chen et al., 2016)。（數(shù)據(jù)庫(kù)網(wǎng)址：http://reprod.njmu.edu.cn/circrnadb）文中作者通過匯總整理，共收集了32914條人類外顯子環(huán)狀RNA記
circRNA 吉賽生物 - 環(huán)狀RNA，環(huán)狀RNA的數(shù)據(jù)庫(kù) - 2016-10-15
Nat Biotechn：CRISPR篩選發(fā)現(xiàn)非編碼DNA的調(diào)控功能
近期來(lái)自杜克大學(xué)的一組研究人員研發(fā)出了一種新工具，通過CRISPR-Cas9表觀基因組編輯方法提出了一種高通量篩選技術(shù)，識(shí)別出了人類細(xì)胞基因組中的調(diào)控元件。
生物通 - CRISPR，非編碼DNA - 2017-04-07
Science/PNAS：中國(guó)學(xué)者參與，2頂尖實(shí)驗(yàn)室聯(lián)手合作，發(fā)現(xiàn)新冠病毒基因可以整合到人類基因組中
SARS-CoV-2 RNA可以被逆轉(zhuǎn)錄并整合到培養(yǎng)的人類細(xì)胞DNA中的可能性
“iNature”微信公眾號(hào) - 新冠病毒 - 2021-05-12
Nature：在試管中創(chuàng)造另一個(gè)進(jìn)化史
來(lái)自芝加哥大學(xué)的研究人員分析了一種古老蛋白的許多遺傳變體，發(fā)現(xiàn)了無(wú)數(shù)種可能的其它進(jìn)化方式，揭示了進(jìn)化史上關(guān)鍵因素的核心作用。
生物通 - 古老蛋白，遺傳突變 - 2017-09-20
新生兒缺氧缺血性腦病磁共振診斷與損傷類型的分類建議
磁共振成像（MRI）能很好地呈現(xiàn)HIE 損傷類型、損傷進(jìn)程，且與其遠(yuǎn)期神經(jīng)發(fā)育結(jié)局密切相關(guān)，但不同MRI 檢查序列所反映的損傷表現(xiàn)可能不盡相同。彌散加權(quán)序列適宜的檢查時(shí)間為出生后2~4 d，常規(guī)序列為出生后的4~8 d。HIE 的MRI 主要損傷類型有丘腦基底
中國(guó)當(dāng)代兒科雜志.2017,19(12):1225-1233. - 新生兒缺氧缺血性腦病，磁共振診斷，損傷類型 - 2018-01-07
Science：張峰等人發(fā)現(xiàn)CRISPR在非編碼基因組中的應(yīng)用
兩個(gè)獨(dú)立的研究小組分別證明了基于 CRISPR 的技術(shù)可以用于識(shí)別疾病相關(guān)基因的關(guān)鍵調(diào)控元件 來(lái)自麻省理工學(xué)院，Broad研究院等處的研究人員利用一個(gè)大型單導(dǎo)向RNA（sgRNA）文庫(kù)，發(fā)現(xiàn)了影響癌癥患者耐藥性的基因的非編碼調(diào)控元件
MedSci原創(chuàng) - 張峰，CRISPR - 2016-10-03
Science：解析CRISPR/Cas的分子機(jī)制
CRISPR/Cas 是源于細(xì)菌及古細(xì)菌中的一種后天免疫系統(tǒng)，它可利用靶位點(diǎn)特異性的RNA指導(dǎo) Cas 蛋白對(duì)靶位點(diǎn)序列進(jìn)行修飾。自2013
生物360 - RISPR/Cas9，基因編輯 - 2014-08-08
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