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Cell:解密DNA的“朋友圈”:新型光交聯(lián)技術(shù)精準(zhǔn)捕獲DNA直接結(jié)合蛋白質(zhì)

Cell:解密DNA的“朋友圈”:新型光交聯(lián)技術(shù)精準(zhǔn)捕獲DNA直接結(jié)合蛋白質(zhì)

《Cell》研究開發(fā) “零距離光交聯(lián)” 技術(shù),利用 4ST 標(biāo)記和 UVEN 系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)單氨基酸分辨率、分鐘級動態(tài)檢測,揭示 DNA 互作蛋白質(zhì)組及無序區(qū)域關(guān)鍵作用。

生物探索 - 零距離光交聯(lián),DNA互作蛋白質(zhì)組 - 2025-05-27

蛋白表達(dá)系統(tǒng)的進(jìn)化史

蛋白表達(dá)系統(tǒng)的進(jìn)化史

重組蛋白表達(dá)系統(tǒng)涵蓋原核、酵母、哺乳動物、昆蟲、植物及無細(xì)胞系統(tǒng),各有優(yōu)劣,應(yīng)用于生物醫(yī)藥等領(lǐng)域,未來或?qū)崿F(xiàn) “按需定制表達(dá)”。

小藥說藥 - 重組蛋白,蛋白表達(dá)系統(tǒng) - 2025-06-22

Nat Methods:突破蛋白質(zhì)互作預(yù)測瓶頸!新交互語言模型SWING實(shí)現(xiàn)跨類型、跨物種精準(zhǔn)預(yù)測,助力變異效應(yīng)解析

Nat Methods:突破蛋白質(zhì)互作預(yù)測瓶頸!新交互語言模型SWING實(shí)現(xiàn)跨類型、跨物種精準(zhǔn)預(yù)測,助力變異效應(yīng)解析

美國團(tuán)隊(duì)開發(fā)的 SWING 模型,通過交互語言建模,精準(zhǔn)預(yù)測 pMHC 互作,實(shí)現(xiàn)跨類型、跨物種零樣本學(xué)習(xí),優(yōu)于傳統(tǒng)工具,助力蛋白質(zhì)互作研究。

測序中國 - 蛋白質(zhì)相互作用,SWING模型 - 2025-07-31

Nature Methods:Chip-Tip技術(shù):突破單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)研究瓶頸的革命性進(jìn)展

Nature Methods:Chip-Tip技術(shù):突破單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)研究瓶頸的革命性進(jìn)展

單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)為生命科學(xué)研究帶來機(jī)遇,但面臨技術(shù)挑戰(zhàn)?!癈hip-Tip” 方法提升分析靈敏度與通量,可深度分析蛋白質(zhì)及翻譯后修飾,在多領(lǐng)域有應(yīng)用潛力,未來需克服多方面挑戰(zhàn)。

生物探索 - 單細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué),Chip-Tip - 2025-01-19

西湖大學(xué)郭天南團(tuán)隊(duì)《自然·通訊》:開發(fā)首個預(yù)訓(xùn)練DIA蛋白質(zhì)譜AI模型,顯著提升蛋白質(zhì)組鑒定深度

西湖大學(xué)郭天南團(tuán)隊(duì)《自然·通訊》:開發(fā)首個預(yù)訓(xùn)練DIA蛋白質(zhì)譜AI模型,顯著提升蛋白質(zhì)組鑒定深度

西湖大學(xué)郭天南團(tuán)隊(duì)等推出預(yù)訓(xùn)練 DIA 蛋白質(zhì)譜 AI 模型 DIA-BERT,提升 DIA 蛋白組鑒定深度,優(yōu)于 DIA-NN,定量準(zhǔn),對低豐度蛋白效果好,軟件開源。

BioMed科技 - 蛋白質(zhì)組,DIA-BERT - 2025-04-16

Cell:告別“一刀切”:骨骼肌深層分子圖譜,開啟糖尿病精準(zhǔn)醫(yī)療新篇章!

Cell:告別“一刀切”:骨骼肌深層分子圖譜,開啟糖尿病精準(zhǔn)醫(yī)療新篇章!

《Cell》研究通過蛋白質(zhì)組學(xué)分析 120 余名志愿者骨骼肌,發(fā)現(xiàn)禁食狀態(tài)分子特征可精準(zhǔn)預(yù)測胰島素敏感性,揭示 JNK-p38 通路等關(guān)鍵機(jī)制,男女代謝有差異但核心機(jī)制相似,為糖尿病精準(zhǔn)治療提供方向。

生物探索 - 胰島素抵抗,2型糖尿病 - 2025-06-03

Nature:C末端酰胺修飾:為蛋白質(zhì)降解提供臨床治療的新武器

Nature:C末端酰胺修飾:為蛋白質(zhì)降解提供臨床治療的新武器

這項(xiàng)研究揭示了FBXO31在蛋白質(zhì)質(zhì)量控制中的核心作用,尤其是在應(yīng)對氧化壓力時,F(xiàn)BXO31能夠識別和清除那些由于氧化損傷而產(chǎn)生的C末端酰胺標(biāo)記的蛋白質(zhì)。

生物探索 - 蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài),C末端酰胺,F(xiàn)BXO31 - 2025-02-02

Cell:萬物可控:機(jī)器學(xué)習(xí)如何解鎖蛋白質(zhì)“開關(guān)”,開啟活體按需功能調(diào)控新時代?

Cell:萬物可控:機(jī)器學(xué)習(xí)如何解鎖蛋白質(zhì)“開關(guān)”,開啟活體按需功能調(diào)控新時代?

《Cell》研究開發(fā) CAGE-Proxvivo 策略,借助機(jī)器學(xué)習(xí)設(shè)計非天然氨基酸 “籠子” 與化學(xué) “鑰匙”,實(shí)現(xiàn)活體小鼠內(nèi)蛋白質(zhì)功能精準(zhǔn)可逆調(diào)控,為腫瘤治療、免疫調(diào)節(jié)等領(lǐng)域提供新工具。

生物探索 - 腫瘤治療,蛋白質(zhì)激活 - 2025-06-02

Nat Methods:鏈接基因變異與蛋白質(zhì)序列和結(jié)構(gòu)的強(qiáng)大生信工具:G2P

Nat Methods:鏈接基因變異與蛋白質(zhì)序列和結(jié)構(gòu)的強(qiáng)大生信工具:G2P

本研究開發(fā) Genomics 2 Proteins 平臺,連接基因組與蛋白質(zhì)組,將遺傳變異映射到蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),為分析變異與疾病關(guān)系提供工具。

測序中國 - 遺傳變異,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),G2P - 2024-10-22

Nature:蛋白質(zhì)測序技術(shù)突破:PASTOR單分子水平精準(zhǔn)解讀蛋白質(zhì)突變和修飾

Nature:蛋白質(zhì)測序技術(shù)突破:PASTOR單分子水平精準(zhǔn)解讀蛋白質(zhì)突變和修飾

研究者開發(fā)了一種基于納米孔的長鏈蛋白質(zhì)單分子讀取方法,通過結(jié)合ClpX解折酶(unfoldase)的作用,使蛋白質(zhì)以可控的方式通過CsgG納米孔,實(shí)現(xiàn)了對長達(dá)數(shù)百個氨基酸的完整蛋白質(zhì)鏈進(jìn)行測序。

生物探索 - 蛋白質(zhì)測序,PASTOR - 2024-09-13

Psoriasis:人類血漿蛋白質(zhì)組學(xué)和孟德爾隨機(jī)化的綜合分析揭示銀屑病新的蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物

Psoriasis:人類血漿蛋白質(zhì)組學(xué)和孟德爾隨機(jī)化的綜合分析揭示銀屑病新的蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物

本研究的目的是探索與銀屑病相關(guān)的蛋白質(zhì)組在成人群隊(duì)列中發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)志物。

MedSci原創(chuàng) - 銀屑病,蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物,血漿蛋白質(zhì)組學(xué) - 2024-12-19

Nature Methods:揭示糖基化奧秘:GlycoShape工具助力精準(zhǔn)糖蛋白結(jié)構(gòu)恢復(fù)與疾病研究

Nature Methods:揭示糖基化奧秘:GlycoShape工具助力精準(zhǔn)糖蛋白結(jié)構(gòu)恢復(fù)與疾病研究

GlycoShape 是糖鏈結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫和工具箱,能恢復(fù)糖蛋白結(jié)構(gòu),通過算法連接糖鏈與蛋白質(zhì),在生命科學(xué)研究中有廣泛應(yīng)用前景。

生物探索 - 糖基化,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),GlycoShape - 2024-10-18

Nature Methods:從“猜”到“預(yù)見”:AI模型PUPS揭示單細(xì)胞蛋白質(zhì)定位的秘密

Nature Methods:從“猜”到“預(yù)見”:AI模型PUPS揭示單細(xì)胞蛋白質(zhì)定位的秘密

《自然?方法》研究提出 PUPS 方法,結(jié)合蛋白質(zhì)語言模型與圖像修補(bǔ)模型,可預(yù)測未知蛋白質(zhì)在單細(xì)胞中的亞細(xì)胞定位,捕捉跨細(xì)胞系及單細(xì)胞變異性,為解析蛋白質(zhì)動態(tài)行為提供新工具。

生物探索 - 蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位,單細(xì)胞變異性 - 2025-05-21

Nature:計算蛋白質(zhì)設(shè)計:AI如何重塑生物學(xué)的未來

Nature:計算蛋白質(zhì)設(shè)計:AI如何重塑生物學(xué)的未來

本文介紹計算蛋白質(zhì)設(shè)計與機(jī)器學(xué)習(xí)進(jìn)展,包括突破、挑戰(zhàn)及在結(jié)合預(yù)測、催化劑設(shè)計、構(gòu)象變化、復(fù)雜結(jié)構(gòu)設(shè)計等方面的應(yīng)用,強(qiáng)調(diào)合作推動發(fā)展及廣闊前景。

生物探索 - 機(jī)器學(xué)習(xí),計算蛋白質(zhì)設(shè)計 - 2024-11-06

了解癌癥中的蛋白質(zhì)脂質(zhì)化

了解癌癥中的蛋白質(zhì)脂質(zhì)化

調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)脂質(zhì)化為我們提供一種獨(dú)特的方法,通過控制其膜結(jié)合、運(yùn)輸、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性和蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用,靶向其他難以治療的癌蛋白。隨著我們對癌癥中蛋白質(zhì)脂質(zhì)化相關(guān)性認(rèn)識的發(fā)展,新的治療機(jī)會可能會出現(xiàn)。

小藥說藥 - 癌癥,蛋白質(zhì)脂質(zhì)化 - 2024-09-12

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