Nature子刊 | 多用途深度學習方法sciPENN，可預測、插補scRNA-seq、CITE-seq蛋白質表達
綜上所述，研究團隊開發(fā)了sciPENN深度學習模型，可以預測和估算蛋白質表達，集成多個CITE-seq數(shù)據(jù)集，量化預測和估算不確定性。
測序中國 - sciPENN，、插補scRNA-seq，CITE-seq蛋白質表達 - 2022-11-24
Nature子刊：多用途深度學習方法sciPENN，可預測、插補scRNA-seq、CITE-seq蛋白質表達
研究團隊開發(fā)了sciPENN深度學習模型，可以預測和估算蛋白質表達，集成多個CITE-seq數(shù)據(jù)集，量化預測和估算不確定性。
測序中國 - 基因測序，深度學習 - 2022-11-24
Front Immunol：強直性脊柱炎患者外周血單個核細胞的整合單細胞RNA-SEQ和ATAC-SEQ分析
強直性脊柱炎(AS)是一種免疫介導的脊柱關節(jié)病。該研究集中在T細胞如何參與AS的發(fā)病機制，這將豐富AS單細胞研究的數(shù)據(jù)，為理解AS的發(fā)病機制提供新的視角。
MedSci原創(chuàng) - 強直性脊柱炎，整合單細胞RNA-SEQ，ATAC-SEQ - 2022-02-19
SCI REP：利用 RNA-Seq 鑒別細菌和病毒感染
近日，國際雜志 《SCI REP》在線發(fā)表一項關于利用 RNA-Seq 鑒別細菌和病毒感染的研究。
MedSci原創(chuàng) - 感染，細菌 - 2017-08-06
Science：開發(fā)出TT-Seq技術繪制人類瞬時轉錄組圖譜
基因之間的序列長期以來被視為“垃圾DNA”，我們如今知道它們也發(fā)揮著至關重要的功能。這些DNA區(qū)域發(fā)生的突變能夠嚴重地對人類發(fā)育造成損害，而且可能在生命后期導致嚴重疾病。然而，在此之前，調節(jié)性DNA序列一直很難發(fā)現(xiàn)。如今，在一項新的研究中，德國慕尼黑理工大學計算生物學教授Julien Gagneur團隊和德國馬克斯普朗克生物物理化學研究所教授Patrick Cramer團隊如今開發(fā)出一種方法可
生物谷 - TT-Seq技術，人類瞬時轉錄 - 2016-06-04
Nucleic Acids Res:Tn-Seq數(shù)據(jù)統(tǒng)計方法新進展
近期，Nucleic Acids Res中一篇文章指出，Tn-Seq數(shù)據(jù)統(tǒng)計方法有了新進展。Tn-Seq是一種通過對復雜的隨機轉座子插入庫的構造，來探索基因功能的實驗方法；通過使用新一代的測序技術，對每一個突變的度進行量化。識別基因的相互作用是Tn-Seq的一項新興應用，這包含了在不同遺傳背景下進行Tn突變庫的比較（例如野生型菌株與敲除型的比較）。為了識別基因間的相互作用，提出幾種Tn-Seq數(shù)據(jù)
MedSci原創(chuàng) - Tn-Seq，量化，基因 - 2017-03-25
Bartter 綜合征（BS）低鉀血癥嚴重程度分級
2023-08-29
利用Perturb-Seq和CRISP-Seq大規(guī)模平行分析數(shù)以萬計基因擾動
單細胞篩選：一種向導RNA（gRNA）文庫---每個gRNA靶向一個獨特的基因用于CRISPR干擾，并且攜帶一種獨特的條形碼序列---被導入一個細胞群體中，這個細胞群體的密度確保一個gRNA平均進入一個細胞中。單個細胞隨后被分選到攜帶添加著獨特條形碼的polyT引物的液滴中，這些引物被用來提取細胞的mRNA。隨后，對這些mRNA進行測序揭示出引入的基因突變（所引入的突變是由gRNA決
生物谷 - 基因擾動，CRISPR，Cas9，Perturb-Seq，CRISP-Seq，向導RNA，mRNA，條形碼 - 2017-03-28
CLIP-seq—動物miRNA靶基因篩選新方法
CLIP-seq，即紫外交聯(lián)免疫沉淀結合高通量測序(crosslinking-immunprecipitation and high-throughput sequencing),是一項在全基因組水平揭示
MedSci原創(chuàng) - CLIP-seq，miRNA - 2014-01-10
基于RNA-Seq的長非編碼RNA（lncRNA）預測
當前l(fā)ncRNA研究主要采用高通量RNA-Seq測序技術，并通過生物信息學方法對測序數(shù)據(jù)進行處理和分析，以挖掘其中l(wèi)ncRNA的序列、結構、表達及功
生物化學與生物物理學進展 - RNA-Seq，長非編碼RNA - 2014-01-03
甲基化DNA免疫共沉淀測序原理及簡介（MeDIP-seq）
MeDIP-Seq（Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing）測序是基于抗體富集原理進行測序的全基因組甲基化檢測技術，采用甲基化DNA免疫共沉淀技術研究人員可以利用MeDIP-Seq
MedSci原創(chuàng) - 甲基化，免疫共沉淀 - 2014-02-05
RNA-seq方法原理、數(shù)據(jù)分析、數(shù)據(jù)庫及工具全面介紹
bsp;- De novo assembly of short reads with robust error correction. An improvement on early versions of SSAKE. *?Velvet?- Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for sho
MedSci原創(chuàng) - RNA-Seq，數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)庫 - 2014-01-04
RNA-seq技術揭示與前列腺癌有關的新型融合基因
973首席科學家第二軍醫(yī)大學上海長海醫(yī)院孫穎浩教授運用RNA-seq技術首次對中國人前列腺癌及癌旁組織進行系統(tǒng)研究，發(fā)現(xiàn)新型融合基因、癌相關長鏈非編碼RNA、異構體和點突變。研究
MedSci原創(chuàng) - 前列腺癌，融合基因 - 2012-03-21
為您找到相關結果約500個
