宏基因組學(xué)一詞是指使用測序方法從樣本中存在的所有生物體中同時識別基因組材料，其優(yōu)勢是比培養(yǎng)或其他方法具有更高的分類分辨率。應(yīng)用包括病原體檢測和發(fā)現(xiàn)、物種表征、抗菌素耐藥性檢測、毒力分析以及影響健康的微

感染是急危重癥患者死亡的主要原因之一。近年來， 隨著新發(fā)病原微生物的出現(xiàn)、耐藥病原微生物的增多以及 免疫抑制宿主的增加，感染的發(fā)病率和死亡率仍居高不下， 膿毒癥 ( 嚴(yán)重感染 ) 患者病死率高達(dá) 50% [1-3]。最新調(diào)查研 究發(fā)現(xiàn)，中國膿毒癥相關(guān)性標(biāo)化死亡率為66.7例/10萬人口， 全國每年共有膿毒癥相關(guān)性死亡病例近 103 萬例 [3]。重癥 感染起病急、進(jìn)展快、病原體復(fù)雜，短

從宏基因組測序推斷的微生物組成數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析指南

宏基因測序技術(shù)實驗流程操作略顯繁瑣，分析流程復(fù)雜，檢測結(jié)果冗長，因此對實驗室操作人員及解讀人員的素質(zhì)要求頗高，對相關(guān)的質(zhì)量控制也需要標(biāo)準(zhǔn)化。簡述了該技術(shù)在醫(yī)院獲得性肺炎中的應(yīng)用及關(guān)鍵環(huán)節(jié)的質(zhì)量控制。

宏基因組下一代測序（mNGS）技術(shù)直接針對標(biāo)本中核酸無偏倚檢測病原微生物序列。但是，mNGS需經(jīng)標(biāo)本前處理、核酸提取、文庫制備、上機測序、數(shù)據(jù)庫比對、報告生成及結(jié)果解讀等一系列過程，對技術(shù)平臺及人員素

宏基因組測序（mNGS）在新發(fā)突發(fā)傳染病以及常規(guī)檢驗陰性的感染性疾病診斷中發(fā)揮了重要作用。近期，國內(nèi)相繼發(fā)表了多個共識闡述了臨床應(yīng)用及實驗室規(guī)范，但生物信息分析程序及方法也是mNGS重要環(huán)節(jié)，而目前學(xué)

基于宏基因組學(xué)測序（mNGS）的病原學(xué)診斷技術(shù)是一種非靶向的廣譜病原學(xué)篩查技術(shù)，近幾年越來越多的研究表明其在重癥感染領(lǐng)域，特別是疑難、罕見病導(dǎo)致的重癥感染中發(fā)揮了關(guān)鍵性作用。由于mNGS 高昂的成本及

病原學(xué)診斷對感染性疾病精準(zhǔn)診療的價值至關(guān)重要。