中國(guó)科學(xué)院上海免疫與感染研究所晁彥杰課題組《自然·通訊》：開(kāi)發(fā)出解析微生物活細(xì)胞RNA-RNA互作圖譜的新技術(shù)iRIL-seq
該研究開(kāi)發(fā)了一項(xiàng)全新的RNA互作組高通量研究技術(shù)，使用該技術(shù)能在微生物活細(xì)胞內(nèi)快速鑒定RNA-RNA分子間相互作用，在轉(zhuǎn)錄后水平發(fā)現(xiàn)新的基因調(diào)控機(jī)制。
BioMed科技 - RNA互作組高通量研究技術(shù)，RNA互作網(wǎng)絡(luò)圖譜 - 2023-12-13
Genes Dev：徐永鎮(zhèn)研究組揭示腫瘤細(xì)胞SF3B1突變導(dǎo)致RNA剪接紊亂的分子機(jī)制
作為RNA加工過(guò)程的關(guān)鍵步驟，RNA剪接的精確性是基因得以正常表達(dá)的先決條件之一，RNA剪接異常導(dǎo)致的基因表達(dá)紊亂是多種疾病發(fā)生的重要原因。近年來(lái)，高通量測(cè)序技術(shù)檢測(cè)發(fā)現(xiàn)各類腫瘤細(xì)胞中存在多種剪接因子突變，這些突變均不同程度地影響了RNA剪接，導(dǎo)致下游基因表達(dá)異常。
上海生命科學(xué)研究院 - SF3B1，RNA剪接，腫瘤細(xì)胞 - 2017-04-24
Mol Cell：薛愿超團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)CRIC-seq技術(shù)，揭示PTBP1調(diào)控可變剪接新機(jī)制
在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中，前體mRNA能夠通過(guò)可變剪接產(chǎn)生多種異構(gòu)體，以執(zhí)行相似或不同的生物學(xué)功能?？勺兗艚拥漠惓Ｅc惡性腫瘤和神經(jīng)退行性疾病等重大疾病的發(fā)生密切相關(guān)。
“生物世界”公眾號(hào) - PTBP1，CRIC-seq技術(shù) - 2023-03-27
長(zhǎng)鏈非編碼RNA（LncRNA）的研究策略
“小”RNA的研究已結(jié)出了累累碩果，“大”RNA的世界里，又有什么寶藏呢？眾所周知，lncRNA淘金熱，也來(lái)了。長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long noncoding RNA, lncRNA) 指的是長(zhǎng)度超過(guò)200nt的RNA分子。它們不編碼蛋白，位于細(xì)胞核或胞質(zhì)內(nèi)。lncRNA最開(kāi)始在一項(xiàng)
MedSci原創(chuàng) - lncRNA，研究 - 2014-01-07
Cell發(fā)布CRISPR研究新成果
來(lái)自斯坦福大學(xué)、加州大學(xué)舊金山分校的研究人員報(bào)告稱，他們利用CRISPR干擾（CRISPRi）技術(shù)，對(duì)枯草桿菌的必需基因進(jìn)行了全面的功能分析。這項(xiàng)研究發(fā)布在5月26日的《細(xì)胞》（Cell）雜志上。
生物通 - Cell，CRISPR，基因編輯 - 2016-06-01
蛋白質(zhì)芯片-未來(lái)臨床診斷的縮影
編者按：隨著生命科學(xué)研究的不斷深入，作為蛋白質(zhì)組學(xué)重要研究工具、以高通量著稱的蛋白質(zhì)芯片發(fā)揮了越來(lái)越重要的作用。到底蛋白質(zhì)芯片包含哪些內(nèi)容，其發(fā)展趨勢(shì)如何呢？據(jù)了解您從08年開(kāi)始從事生物芯片的研究工作，能簡(jiǎn)單
生物谷 - 蛋白質(zhì)芯片 - 2016-12-14
為何人的基因組測(cè)序沒(méi)完沒(méi)了
隨著測(cè)序技術(shù)的迅猛發(fā)展，高通量測(cè)序在科學(xué)研究中的運(yùn)用也越來(lái)越廣泛。而人類的參考基因組也在不停地更新，那么問(wèn)題來(lái)了，為何人的基因組測(cè)序沒(méi)完沒(méi)了？
知乎 - 基因組測(cè)序 - 2016-05-24
Nature Methods：解碼RNA與蛋白質(zhì)相互作用的新視角：TREX技術(shù)的突破
TREX技術(shù)，作為一種創(chuàng)新的實(shí)驗(yàn)方法，為研究活細(xì)胞中特定RNA區(qū)域與RNA結(jié)合蛋白之間的互作提供了強(qiáng)有力的工具。
生物探索 - RNA分子，TREX技術(shù) - 2024-02-27
Protein & Cell：王永成/樊龍江團(tuán)隊(duì)合作開(kāi)發(fā)微生物組單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)
該研究建立了基于隨機(jī)引物的高通量單細(xì)胞RNA測(cè)序技術(shù)及其數(shù)據(jù)分析方法，首次實(shí)現(xiàn)了復(fù)雜微生物組樣本的高通量單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序與分析。
測(cè)序中國(guó) - 微生物組，單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序 - 2024-06-01
Cell Stem Cell：人類胚胎期生殖細(xì)胞基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制
4月27日，清華-北大生命科學(xué)聯(lián)合中心、北京大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院BIOPIC中心湯富酬研究組與北醫(yī)三院?jiǎn)探?font color="red">研究組在Cell Stem Cell雜志在線發(fā)表了一篇研究論文，首次在單細(xì)胞分辨率和全轉(zhuǎn)錄組水平，系統(tǒng)闡明了人類胚胎性腺中生殖細(xì)胞及其微環(huán)境細(xì)胞發(fā)育過(guò)程中的基因表達(dá)圖譜及其調(diào)控機(jī)理
BioArt - 胚胎，生殖 - 2017-05-02
長(zhǎng)鏈非編碼RNA（lncRNA）靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù)及預(yù)測(cè)軟件匯總
國(guó)內(nèi)外長(zhǎng)鏈非編碼RNA的研究剛剛興起，但已有相當(dāng)多數(shù)據(jù)庫(kù)資源供大家參考。（1） ChIPBase: 提供長(zhǎng)鏈非編碼RNA的表達(dá)圖譜和轉(zhuǎn)錄調(diào)控的全面鑒定和注釋。整合了高通量的RNA-seq鑒定的lncRNA及其表達(dá)圖譜和ChIP-Seq實(shí)驗(yàn)技術(shù)鑒定的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)。
MedSci原創(chuàng) - lncRNA，數(shù)據(jù)庫(kù)，軟件 - 2014-01-10
microRNA靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù)及預(yù)測(cè)軟件匯總
一、miRNA的定義 miRNA(microRNA)是一組由基因組編碼的長(zhǎng)度約17～25個(gè)核苷酸的非編碼RNA，通過(guò)和靶基因mRNA堿基配對(duì)引導(dǎo)沉默復(fù)合體(RISC)降解mRNA或阻礙其翻譯。
MedSci原創(chuàng) - microRNA，數(shù)據(jù)庫(kù) - 2014-01-10
miRNA介紹、命名原則、功能分析、miRNA數(shù)據(jù)庫(kù)大全
microRNA(miRNA)是一類長(zhǎng)度約為19-25nt的內(nèi)源性非編碼RNA，廣泛參與基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控活動(dòng)，其中多數(shù)miRNA具有高度序列保守性、表達(dá)時(shí)序性和組織特異性。最近的研究表明miRNA參與各種各樣的調(diào)節(jié)途徑，包括發(fā)育、病毒防御、造血過(guò)程、器官形成、細(xì)胞增殖和凋亡、脂肪代謝等，具有重要的基因表達(dá)調(diào)控作用。
MedSci原創(chuàng) - miRNA，命名，數(shù)據(jù)庫(kù) - 2016-01-08
Nature：納米孔測(cè)序技術(shù)的發(fā)明人再發(fā)明單分子互作測(cè)序
隨著技術(shù)的發(fā)現(xiàn)，大規(guī)模并行DNA測(cè)序得到了廣泛的應(yīng)用，為許多研究領(lǐng)域帶來(lái)了一場(chǎng)革命。然而，高通量的蛋白質(zhì)分析仍然困難重重，現(xiàn)在亟需高質(zhì)量低成本的蛋白分析技術(shù)。為此，遺傳學(xué)界的大牛George M.Church領(lǐng)導(dǎo)哈佛醫(yī)學(xué)院的團(tuán)隊(duì)，開(kāi)發(fā)了一種單分子互作測(cè)序（SMI-seq）技術(shù)。該技術(shù)能夠?qū)崿F(xiàn)單分子水平上的并行分析，獲得大量蛋白質(zhì)的互作圖譜。
MedSci原創(chuàng) - 納米孔，單分子 - 2014-10-04
Biotechniques：盤點(diǎn)癌癥中的microRNA
MicroRNA是可以沉默基因表達(dá)的非編碼單鏈短RNA分子。盡管越來(lái)越多的證據(jù)表明，microRNA在癌癥中的作用很重要，但人們依然對(duì)其知之甚少?？的螤柎髮W(xué)的系統(tǒng)生物學(xué)家Xiling Shen利用免疫熒光和RNA熒光原位雜交，
不詳 - microRNA，癌癥化療 - 2014-01-23
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